BOAGA desenvolve o seu traballo centrado no apoio directo ás persoas criadoras, ofrecendo asesoramento técnico e impulsando programas de mellora xenética e sanitaria das distintas razas. A federación encárgase tamén da xestión dos libros xenealóxicos e da coordinación entre as asociacións que a integran, garantindo un seguimento rigoroso das poboacións e contribuíndo á súa conservación a longo prazo mediante ferramentas técnicas e organizativas.

Así mesmo, actúa como entidade representativa do sector fronte ás administracións e outras organizacións, participando na definición de políticas e iniciativas relacionadas coa gandaría autóctona. BOAGA impulsa proxectos de divulgación, comercialización e posta en valor dos produtos destas razas, co obxectivo de reforzar a viabilidade económica das explotacións e asegurar a continuidade dun modelo gandeiro ligado ao territorio e á sustentabilidade do medio rural galego.